斑马鱼转录组测序分析
竞价公告(JJ19122511330271)
开始时间:2019-12-25 11:33:00 截止时间:2019-12-28 11:33:00 ...
采购单位:华南师范大学
联系人:李丹
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质疑电话:18642089310
项目名称:斑马鱼转录组测序分析
竞价编号:JJ19122511330271
采购类型:其他
开始时间:2019-12-25 11:33:00
结束时间:2019-12-28 11:33:00
最高限价(元):已隐藏
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备注:
     项目名称:斑马鱼转录组测序分析
序号 产品名称 品牌 产品类别 型号 数量 单位 是否标配 详情
1 斑马鱼测序分析 转录组测序 其他 无测序分析 12.00
规格配置:规格配置:完成 12个 斑马鱼 (物种)(拉丁名)RNA样品常规RNA-seq,每个样本产生_6_Gb的clean data,并完成相应的信息分析。 完成12个组织样本RNA提取跟检测。 在各样本总数据量达标的情况下,每个样本数据量不低于目标数据量的90%,平均Q20≥90%,平均Q30≥80%
售后服务:售后服务:1. 数据质控:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理。2. 比对分析:比对核糖体序列、参考基因组(或其他参考序列) 3. 基因分析:3.1 新基因鉴定;3.2基因覆盖度;3.3测序饱和度分析;3.4基因测序随机性分析;4. 基因表达量统计(表达量计算,表达量丰度分布) ;5. 样本关系分析(基于表达量)5.1主成分分析(PCA);5.2相关性系数热图;6. 差异表达基因分析(至少两个分组,每个分组两个或两个以上样品)6.1 差异表达基因筛选;6.2 差异基因散点图与火山图 6.3 差异基因表达模式聚类分析(热图);6.4 差异基因GO功能显著性富集分析(富集气泡图、柱形图绘制);6.5 差异基因KEGG显著性富集分析(富集气泡图、柱形图绘制);7. 蛋白互作网络分析(PPI分析) 7.1 String数据库蛋白互作网络分析;7.2 网络图绘制;8. GSEA分析 (Gene Set Enrichment Analysis);8.1基于GSEA的GO富集分析;8.2基于GSEA的KEGG富集分析;9. InDel/SNP突变分析;10. RNA编辑;11. 已知基因结构优化;12. 基因可变剪切鉴定
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